Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl5P47962 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl5P47962 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms