Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax9P47242 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax9P47242 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms