Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NsfP46460 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NsfP46460 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NsfP46460 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NsfP46460 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsfP46460 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsfP46460 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsfP46460 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NsfP46460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NsfP46460 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsfP46460 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsfP46460 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsfP46460 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsfP46460 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsfP46460 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsfP46460 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsfP46460 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsfP46460 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsfP46460 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsfP46460 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsfP46460 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NsfP46460 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NsfP46460 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsfP46460 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NsfP46460 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms