Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syt1P46096 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syt1P46096 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syt1P46096 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syt1P46096 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syt1P46096 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms