Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hmx2P43687 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmx2P43687 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmx2P43687 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms