Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tlx1P43345 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tlx1P43345 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tlx1P43345 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms