Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clec3bP43025 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clec3bP43025 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms