Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NodalP43021 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NodalP43021 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NodalP43021 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NodalP43021 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NodalP43021 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NodalP43021 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NodalP43021 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NodalP43021 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NodalP43021 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NodalP43021 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NodalP43021 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NodalP43021 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NodalP43021 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NodalP43021 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms