Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd9P40240 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd9P40240 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd9P40240 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms