Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprkP35822 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprkP35822 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprkP35822 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprkP35822 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprkP35822 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprkP35822 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprkP35822 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms