Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn1P35821 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn1P35821 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn1P35821 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptpn1P35821 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms