Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ercc5P35689 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc5P35689 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc5P35689 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms