Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ddit3P35639 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddit3P35639 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddit3P35639 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms