Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc1P35601 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfc1P35601 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms