Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nedd1P33215 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nedd1P33215 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms