Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KrasP32883 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KrasP32883 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KrasP32883 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KrasP32883 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KrasP32883 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KrasP32883 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KrasP32883 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KrasP32883 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KrasP32883 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KrasP32883 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KrasP32883 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KrasP32883 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KrasP32883 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KrasP32883 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms