Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OatP29758 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OatP29758 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OatP29758 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OatP29758 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OatP29758 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OatP29758 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OatP29758 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OatP29758 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OatP29758 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OatP29758 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OatP29758 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OatP29758 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OatP29758 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OatP29758 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OatP29758 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OatP29758 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OatP29758 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OatP29758 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OatP29758 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OatP29758 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OatP29758 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OatP29758 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OatP29758 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OatP29758 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OatP29758 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OatP29758 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OatP29758 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OatP29758 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OatP29758 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OatP29758 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OatP29758 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OatP29758 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OatP29758 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OatP29758 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OatP29758 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OatP29758 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OatP29758 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OatP29758 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OatP29758 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OatP29758 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OatP29758 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OatP29758 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms