Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha3P29319 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Epha3P29319 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Epha3P29319 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epha3P29319 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epha3P29319 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Epha3P29319 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha3P29319 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha3P29319 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha3P29319 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha3P29319 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha3P29319 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha3P29319 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha3P29319 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha3P29319 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms