Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kif5cP28738 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif5cP28738 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms