Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd10P28359 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxd10P28359 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxd10P28359 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms