Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd9P28357 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxd9P28357 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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