Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2-DMaP28078 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-DMaP28078 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-DMaP28078 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms