Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde6aP27664 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde6aP27664 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde6aP27664 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms