Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Xrcc5P27641 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xrcc5P27641 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xrcc5P27641 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Xrcc5P27641 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Xrcc5P27641 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xrcc5P27641 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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