Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tgfb2P27090 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tgfb2P27090 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfb2P27090 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms