Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2af2P26369 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af2P26369 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2af2P26369 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2af2P26369 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af2P26369 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af2P26369 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms