Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmo2P25801 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lmo2P25801 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms