Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Aldh1a1P24549 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aldh1a1P24549 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Aldh1a1P24549 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms