Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkchP23298 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkchP23298 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkchP23298 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkchP23298 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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