Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RarbP22605 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RarbP22605 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RarbP22605 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RarbP22605 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RarbP22605 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RarbP22605 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RarbP22605 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RarbP22605 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RarbP22605 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RarbP22605 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RarbP22605 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RarbP22605 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RarbP22605 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RarbP22605 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RarbP22605 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RarbP22605 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms