Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcaP20444 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcaP20444 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms