Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou5f1P20263 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou5f1P20263 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou5f1P20263 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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