Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl9P18340 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl9P18340 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcl9P18340 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxcl9P18340 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcl9P18340 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms