Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Selenbp1P17563 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Selenbp1P17563 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.1 ms