Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptan1P16546 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptan1P16546 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptan1P16546 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms