Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ca3P16015 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ca3P16015 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ca3P16015 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ca3P16015 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ca3P16015 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ca3P16015 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca3P16015 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca3P16015 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ca3P16015 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ca3P16015 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ca3P16015 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms