Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme1P15532 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme1P15532 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms