Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Myf6P15375 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myf6P15375 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myf6P15375 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Myf6P15375 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Myf6P15375 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms