Protein–RNA interactions for Protein: P12970

Rpl7a, 60S ribosomal protein L7a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl7aP12970 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl7aP12970 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl7aP12970 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms