Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Calb1P12658 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Calb1P12658 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Calb1P12658 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Calb1P12658 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calb1P12658 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Calb1P12658 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Calb1P12658 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms