Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk1P11440 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk1P11440 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk1P11440 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms