Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnp2P11378 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnp2P11378 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms