Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxb4P10284 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb4P10284 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms