Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CatspereP0DP43 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatspereP0DP43 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CatspereP0DP43 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CatspereP0DP43 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms