Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UbbP0CG49 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UbbP0CG49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UbbP0CG49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms