Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csf3P09920 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csf3P09920 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms