Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifna9P09235 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifna9P09235 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms