Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1P09055 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1P09055 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms