Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ifna4P07351 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ifna4P07351 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms