Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TnfP06804 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TnfP06804 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnfP06804 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnfP06804 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TnfP06804 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TnfP06804 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TnfP06804 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TnfP06804 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnfP06804 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnfP06804 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnfP06804 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnfP06804 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TnfP06804 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TnfP06804 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TnfP06804 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TnfP06804 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TnfP06804 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TnfP06804 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TnfP06804 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TnfP06804 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TnfP06804 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TnfP06804 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TnfP06804 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TnfP06804 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TnfP06804 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TnfP06804 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TnfP06804 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms